Le drapeau du Nunavut a été officiellement adopté le 1er avril 1999.
L’étoile est Niqirsuituq, l'étoile Polaire, repère traditionnel, stable et omniprésent pour les navigateurs, à l’image des aînés dans la collectivité.
L’inukshuk, au centre du drapeau, représente les monuments de pierres qui guident les gens sur leur chemin et qui marquent les lieux sacrés et d’autres sites remarquables.
Les couleurs bleu et or symbolisent la richesse de la terre, de la mer et du ciel. Le rouge représente le Canada.
Le drapeau a été dessiné par Andrew Qappik, de Pangnirtung.